文来日高课程创新性地开设了2+1.5与3+0的多元升学通道，让学生可以在高中阶段，根据自身成长情况和需求进行选择，经由推荐或留考，赴日深造，最终无缝衔接日本教育体制。学生在完成高一、高二的学习后，有2种选择。学生可以通过“姐妹校推荐制”进入日本大学，也可以通过EJU留考考入日本高校。而对于文高学生来说，学校提供严密的进阶课程体系能够让他们自由灵活选择，随时切换。
为了更好地发展与日本高中及大学的合作交流，学校在日本上智大学设立了上海市文来高中东京事务所，以与日本高中及大学的教育交流为主轴展开活动。具体而言，包括策划和实施与日本高中的交流项目，支持我校赴日留学生的学习和生活，与日本大学进行升学咨询和信息提供等。另外，通过举办文化活动和交流会，运营学生和教师的交流项目，来建立日本和中国教育机构之间的密切关系。
1.“3+0”学制升学
“3+0”的学制能够让学生更有针对性地面向日本EJU留学考试。学校从留考和教材两个方向深入研究和实践。近年来，为应对国内家长对于希望学生更多参与EJU留考、冲击日本顶尖国公立高校的期待，学校延续了针对日本方向留学的调研和设计，以不断提质的3+0课程回馈家长与学生的期待。同时，文来高中以向学生提供多种升学途径为使命，并为此积极努力。学校与早稻田大学、立教大学、大东文化大学、樱美林大学、南山大学、京都女子学院等指定校签订合作协议，为学生提供丰富的升学选择。每年都将有数十名高三学生通过校长推荐直接升入日本名校。
2.“2+1.5”学制升学
“2+1.5”学制保证学生在日高课程班学习两年后，最后一年半的时间进入日本姐妹高中。相应高中拥有推荐名额，只要学生达到一定的标准就可以获得学校推荐。学校有超二十所姐妹高中可选，地理位置覆盖了日本各主要地区，为学生赴日留学提供了便利和保障。同时，为了保证升学数量和质量，其中70%的日本姐妹校是独家合作关系，是业界NO.1，也是同类学校的3倍到6倍。
